《哥谭第三季》的剧情在2016年的美国荧屏上展开，深入揭示了哥谭市的黑暗与混乱。本季中，詹姆斯·戈登作为警探，面对愈发猖獗的犯罪势力，他决心保护这座城市的安宁。与此同时，年轻的布鲁斯·韦恩逐渐揭开了猫头鹰法庭的神秘面纱，这个神秘的组织利用艾丽丝·泰奇的血液企图毁灭哥谭。

戈登在追捕罪犯的过程中，遭遇了彪形大汉的袭击，但他凭借机智和勇气成功制服对手。另一方面，企鹅人科波特与芭芭拉结成了不稳定的联盟，两人为了各自的利益在哥谭市内展开了一系列权谋斗争。

随着剧情的深入，哥谭市的犯罪势力愈发猖獗，而戈登和布鲁斯·韦恩等正义之士则不断努力，希望能够阻止猫头鹰法庭的阴谋，保护这座城市的未来。