《法国小馆儿第五季》的剧情发生在1940年代的二战期间，法国小镇Nouvion（实际拍摄于英国诺福克郡的Lynford Hall）上的一家咖啡馆成为了故事的核心。德军指挥官为了将一幅价值连城的油画《堕落的大波麦当娜》据为己有，强迫咖啡馆主René Artois将画藏于店内。然而，这幅画也引起了纳粹德国领袖希特勒的注意，他派出一名盖世太保军官前来搜寻。

与此同时，咖啡馆内还上演着另一场戏码：若干幅油画的赝品出现，真品与赝品混淆，使得情况更加复杂。画被巧妙地藏在德国香肠中，有的被炸毁，有的被藏匿，还有的甚至成为了某人的晚餐。

除了这些混乱，René还要应对两个被迫降落在该地的英国飞行员，他们躲在咖啡馆中寻求庇护。而全女性的法国抵抗组织则计划将飞行员安全送回英国，但过程中充满了笑料和意外。整个故事围绕着这幅油画和咖啡馆，展现了一个充满混乱、幽默和爱的二战故事。