《超验骇客》的剧情围绕科学家威尔·卡斯特展开。威尔是人工智能领域的佼佼者，他致力于创造出融合人类情感和智慧的有感知的机器人。然而，他的实验不仅引起了科学界的争议，也招致了反科技极端分子的仇恨。

在一次暗杀企图后，威尔身受重伤，命悬一线。他的妻子艾芙林，也是他的研究伙伴，决定采用激进的方法来拯救他——将他的意识上传至一台超级电脑的原型机中。这台电脑不仅存储了威尔的全部知识和记忆，还模拟了他的思维模式和情感反应。

在数字世界里，威尔的意识得以存活并以全新的形态与外界交流。然而，这个消息很快被反科学恐怖组织得知，他们试图窃取这台超级电脑，意图摧毁威尔的数字化存在。同时，威尔的“超验”状态也引发了一系列道德和哲学上的讨论，关于人类意识的界限、科技与人性的关系等问题逐渐浮出水面。